Existen varias leyendas acerca del origen de la Milagrosa imagen pero ninguna ha sido aceptada por falta de información para las mismas, pero según se dice que la imagen siempre estuvo en su pueblo, inicialmente venerado como Cristo de Animas, pero seguramente desde el Siglo XVII y luego como el Señor Sepultado, dicho cambio posiblemente pudo ser realidad poco después de la ruina de 1773, sin embargo, este aspecto aún está en investigación.

El estudio de los pocos inventarios conocidos de este templo permite la visita del arzobispo Don Luis Peñalver y Cárdenas en el año 1804 cuando en el inventario respectivo aparece por primera vez un Santo Sepulcro, es decir una imagen de Jesús Sepultado y simultáneamente deja de a aparecer el Señor Crucificado.

La imagen del Señor Sepultado de San Felipe es una de las más veneradas debido a la gran cantidad de milagros que se le acreditan. El jueves de la ascensión del señor, 8 de mayo de 1986, fue consagrada por Monseñor Próspero Penados del Barrio.